¿A qué te refieres con "el todo"? ¿todo el código php o del html? Como sea, supongo que no se debe poner el HEAD de la página al final de la misma, del html.
Código PHP:
<?
// aqui tu codigo php?
?>
<html>
<head><title><? echo $title; ?></title></head>
<body>
contenido de tu html, estatico o dinamico, no sé
</body>
</html>