Hola:
Para enviar datos debes hacer submit del formulario, ya sea con un botón, como usando el método de los formularios del mismo nombre... lo mejor es que pongas el action normal y tu función de confirmación devuelva el resultado al formulario mediante el onsubmit...
<form action="destino.php" onsubmit="return confirm('¿Quiere enviar el formulario?')"...>
Saludos
