Por cierto,
Cita: osea que lo que escriba en el contenedor sea lo que este en un archivo aparte y no una cadena.
Para hacer eso necesitarías usar Ajax. Aun que de nuevo no veo el motivo por el que querrías hacerlo. Incluir php en una pagina web después de que ha sido cargada no tiene sentido -si es que puede hacerse- ya que el php se ejecuta en el servidor y no en el cliente.