El tema no pasa por el tipo de monitor
sino por la resolución con la cual se está trabajando.
Viendo tu diseño en 800 × 600 px, veo que tu Layer1 "tiende a salir del contenedor".
Aunque en verdad no está dentro de ningún contenedor y está posicionado en forma absoluta. Ese es el problema.
Intentá trabajarlo dentro del layer #header; posiblemente con un float:left
Suerte!