Dominios iguales

[xbx]

Debes colocar una verificación de cuál es el dominio del referer antes de guardar el dato en la BD.
Puedes hacerlo colocando un simple 'if':
if(!preg_match("/^https?\:\/\/(www\.)?midom\.com/",$referer))
{
//aqui guardas el referer en la base de datos
}

$referer es la variable que contiene la dirección del 'referido' (como tú dices).
Cualquier duda puedes pegar tu código para que podamos ayudarte mejor.