No te recomiendo PHP Directory... ( aunque no digo que sea malo, de hecho nunca lo usé )
Si vas a usar algo gratis, usa YALD (
http://yald.eotz.com/ )
Si vas a usar algo pago, usa PHP Link Directory (
www.phplinkdirectory.com)
ambos son lo mejor del mercado. (obviamente el que es pago tiene mas prestaciones y es más apto para SEO).
Saludos!