no... una cosa es que lo uses como herramienta, y otra que lo uses COMO PARTE DEPENDIENTE DE TU SISTEMA.
Si quisieras usar el código de phpmyadmin para desarrollar tu propio administrador de base de datos si deberías licenciarlo bajo GPL, pero si usas phpmyadmin como simple herramienta para crear de un sistema totalmente independiente, no.
La cláusura vírica de la GPL tampoco es que sea un "efecto Midas"
PD: php tiene su propia licencia, la PHP License