ummm tarda 15 minutos en cargar el SO pero una vez que inicia funciona normal o sigue lento.
lo primero que tendrías que hacer es hacer un backup de tus datos, no vaya a ser que como dices que son discos idénticos, pues lo mas probable es que los hayas comprado en la misma fecha y lugar y por ahí sean hasta del mismo lote, como uno se daño pues... mejor es prevenir antes que lamentar
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Deberías hacerle un diagnostico al disco y como dice RobiBaggio una desfragmentada no le caería mal, luego usar algún programa tipo CCleaner o TuneUp, si todo esta correcto pero sigue demorando ya podrías ir pensando en formatearlo e instalar de nuevo.