lo que se me ocurre a mi es pongas un <input type="button" y que a la acción on click dentro del body pongas lo siguiente
<body onclick="setTimeout(window.close, 5000)"> ahi puedes controlar los segundos que quieras en que se cierre la ventana y ahi no te va a preguntar si quieres cerrarlo y ya vas a tener abierto por otro lado el pop up, espero te sirva.
