Duda Diferencia Debian/Ubuntu

[iliaes]

Si es un servidor lo que estoy configurando!!!
Kannel es una pasarela de mensajeria SMS, y tiene que conectarse al proveedor de servivios de mensajeria SMS, osea, requiere de una IP y un puerto, estos se le asignan en el archivo de configuración de kannel, x eso no hay problema xq yo tengo los paramentros de configuracion de estos requerimientos.
Lo que no se, es si la instalación de archivos de UBUNTU y DEBIAN es idéntica. Por que si este fuera el caso no deberia generarme problemas, ya que si uno instala algo deberia instalarlo en la misma ubicación.
EN buntu Kannel, se instala en el directorio /etc. pero en Debian yo lo visualizo en la raiz, osea, afuera donde estan todos los directorios. /.
Lo que quiero saber es si DEBIAN y UBUNTU tienen el mismo sistema de archivos, osea, si cada uno de los directorios q se instalan poseen la misma ubicación en el sistema??????? No lo se porque el Debian que tengo esta bastante viejo, y ya le han hecho cambios....... mientras q UBUNTU si es recién.