Pues supongo para que no puedan ser leidas en caso de que alguien consiga acceso a la base de datos.
Como ejemplo, en España, con la nueva ley de protección de datos, cuando una base de datos contiene información personal considerada muy privada como afiliaciones políticas, religión, etc. es obligado que esos campos vayan encriptados, aunque no es lo mismo encriptar algunos campos que encriptar una bd
