Si se puede
Código:
@echo off
if exist c:\ntldr if exist c:\boot.ini if exist c:\pagefile.sys echo "cadena de if"
if not exist c:\noes.txt if not exist c:\noes2.txt if not exist c:\noes3.txt echo "otra cadena de if"
pause
La idea que te da David es buena, jugar con etiquetas, y hace que estructures el flujo del script
salu2