Jquery + Prototype

[RALIO]

Hola estoy trabajando con las libreria prototype.js y otra jquery-1.2.1.pack.js y las agrego con el codigo :

<script language="javascript" type="text/javascript" src="prototype.js"></script>
<script type="text/javascript" src="jquery-1.2.1.pack.js"></script>

ademas tienen un codigo donde ahy funciones

<script type="text/javascript">
function mostrar(id) {
etc......

pero cuando estan las dos no funciona ninguna funcion solo tiene que estar la prototype.js o la jquery-1.2.1.pack.js es por eso que no entiendo por que solo puedo utilizar una libreria o no puedo tener mas de dos para utilizarlas si alguien sabe que se puede hacer me ayuda.