Hola otra vez:
Creo que lo que deberías hacer es abrir la ventanita desde una función, y la variable ventanitahecerla "global" (o sea que desde otra función la puedas cerrar)
<script lanaguage=javascript>
var ventanita;
function abrir(){
ventanita=window.open(... ///
...
}
function cerrar(){
ventanita.close(); //
location.href=nueva_página;
}
</script>
Saludos