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Phobos, si haces un fopen a un archivo php que está en tu misma máquina, si puedes leerlo y ver el código fuente, pero si quieres hacerle un fopen a un archivo php en otra maquina o servidor, entonces lo que PHP hace es pedir ese archivo de la misma manera que un navegador lo haría, haciendo un GET al apache del otro server.
De esa manera, el apache procesaria el PHP y te devolvería los resultados del proceso y no el código fuente en sí.

Saludos.