Pues no debes usar la funcion window.open(), sino algo como lo siguiente:
Código:
function abrirVentanaSMS(url, name)
{
var parametros =3D "?codigo=3D" + document.sms.codigo.value
+ "&numero=3D" + document.sms.numero.value
+ "&mensaje=3D" + document.sms.mensaje.value
+ "&servicio=3D" + document.sms.servicio.value;
top.location = url+parametros;
}