Con la consulta de abajo, borra aproximadamente 600.000 registros. Pero el proceso se hace muy lento y el servidor queda practicamente inestable. Y no termina de procesar la consulta.
"idATDCliente" es clave primaria. Tendria que ser clave unica ?
Código PHP:
delete from atATDClienteTempMes
where idATDCliente IN (select idATDCliente from atConciliacionParcial60Prueba)