Tu primera consulta para obtener el total debería de ser algo así:
Código:
$sqlex="SELECT COUNT(cedula) AS total FROM factura GROUP BY cedula";
Por otro lado, tienes un problema ya que dentro del while es que tratas de hacer el conteo y paginación y ahí es donde tienes el error, primero debes de hacer el código para paginar, y posteriormente haces el while para dibujar tu tabla.
Saludos.