ENGINE reemplaza a TYPE, es la forma de declarar en la creación de la tabla el motor que va a usar (MyISAM, InnoDB, BDB, FEDERATED, etc.), por lo que lo que corresponde es que diga
al final de la creación de cada tabla.
No te olvides q ue si no las defines, usará el motor por default, que desde la versión 5 es InnoDB y no MyISAM.