... a ver, entendí ya tenías los dos SO instalados. Mencionaste es solo la partición que querías "compartir" la que no veías desde ningún SO, entonces se entiende puedes arrancar bien desde cualquier SO.
Si esto es así, solo bastaría reformatear esa partición que ahora no ves. Entra a Ubuntu...
no recuerdo ahora la distribución de el menú (no uso Ubuntu) pero deberá estar junto con otras herramientas del sistema;
GParted es lo que buscas.
Ya en GParted verás tu disco duro y sus particiones, tendrás la Windows, la Ubuntu, la Swap ... y quizá los 100Gb de tu partición compartida como espacio vacio (disponible). Reformatea esos 100Gb con formato NTFS, dale un punto de montaje (/media/TuParticionCompartida) y listo. Windows debería reconocértela.
Suerte
