Pues viendo tu gabinete a vuelo de pajaro, no deberia haber problemas, es un Full tower y deberia ser lo suficientemente grande para meter hasta una Geforce 9800 GX 2, que mide como medio metro
Respecto al disipador, yo encuentro que es bastante bueno, si yo fuera tu, no lo cambiaría.
Y si la placa base soporta PCI-Express 1.1 y tu VGA es una GIGABYTE 9800GTX 512M GDDR3 (PCI-E 2.0), no tendras problemas de compatibilidad, pero si de velocidad, al ser una tarjeta high-end, usa todo el ancho de banda del PCI- E 2.0 y si quieres hacer correr juegos muy pesados o a altas resoluciones, se te va a crear un cuello de botella.
Salu1+1