Personalmente yo no creo la particion /usr, asi que cuando voy a crear particiones y por defecto me muestra /use la cambio por la que necesito, yo tengo mi sistema con tres particiones creadas, asi:
swap (1 GB)
"/" raiz (10 GB)
/home (resto del disco)
Esta ultima es donde se guardan los archivos del usuario y por eso ocupa mas espacio.
Y en la raiz es donde esta el sistema operativo y todas las aplicaciones que se instalan.
Saludos