Escribir en un archivo sin sobreescribir

[Elyeyo]

Me respondo yo mismo.
No encontré alguna forma de escribirlo sin comerse los caracteres por lo que decidí leer la otra parte del archivo con la función stream_get_contents.
La cual le indiqué desde donde leerlo y asi escribir las dos cadenas que generé

Espero le sirva a alguien

este es el código como quedó

<?php

//Esto encuentra la bandera1 para poder escribir ahi
$archivo = '/Servidor/WEB/Portale2/LeftFrame.php';
$Pf = Fopen($archivo,'r+');
$contents = fread($Pf, filesize($archivo));
$pos = strpos($contents,"BANDERA1");
$pos = $pos-4;
$resto = stream_get_contents($Pf,-1,$pos);
$string = "\n AÑADIDO DESDE AQUI CHEKALO BIEN \n <!--BANDERA1--> \n";
fseek($Pf, $pos);
$write = fputs($Pf, $string.$resto);
print $pos;
fclose($Pf);
?>