Hola.
Respecto a lo que comentas, vuelvo a decir por tercera vez (en lo poco que llevo escribiendo aquí):
Para diseñar, siempre y cuando quieras que todo salga bien, y evitarte dolores de cabeza, nunca lo hagas partiendo del Internet Explorer.
La razón es que este navegador NO respeta los estándares, por lo cual, cuando creas una página que se vea bien en el IE, puedes estar cometiendo errores.
La mejor solución es crear las páginas para un navegador que respete los estándares, como Mozilla Firefox. Otras opciones son Opera, Safari (ahora tambien se publica una version para Windows), etc...
Mientras diseñas para los navegadores "estándares" y respetuosos con las reglas del W3C (El consorcio que dicta las recomendaciones globales para estandarizar y mejorar la web), puedes ir viendo qué problemas aparecen en IE para subsanarlos sobre la marcha.
Como punto de partida, puedo darte un consejo:
Internet Explorer suma los paddings (rellenos) al ancho de los elementos de block (como un div)...
Karma
Un Saludo!