Hay herramientas como Hijackthis y/o ComboFix (por poner dos ejemplos) que necesitan cierto grado de conocimiento en cuanto a reconocimiento de archivos legítimos y los que pertenecen a infecciones, estas herramientas brindan un reporte detallado de los procesos que corren en tu sistema y de acuerdo al reconocimiento de estos procesos se procede a seguir una serie de pasos para poder eliminar la infección.
Saludos