Que tal amigo el visual studio te brinda la opcion de crear sistemas para dispositivos moviles, que van desde la version 2003. Para tener este modulo deves de tener instalado en el visual studio 2005 por recomendacion ya que en el viene instalados los template que se utilizaran para crear este tipo de sistemas, y si tienes mas dudas te recomeindo este sitio web
http://www.todopocketpc.com ami me ayudaron en muchas cosas, bueno espero que te diviertas.