Como "nivel inicial":
Primero siempre los de IE, que serán los "generales".
Después los restantes.
Si lo haces como anteriormente, vas a tener que ser muy específico en cada una de las reglas, si lo haces de esta otra manera, crea la hoja completa para IE, y después haz los ajustes que quieras para los demás browsers.
Código HTML:
<!--[if IE]>
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="estilos/estilosie.css"/>
<![endif]-->
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="estilos/estilos.css"/>
Así debería funcionarte sin problemas.