Como te ha dicho BrujoNic, esto no es de base de datos, pero te diré que la base de datos sí guarda los saltos de línea, y los guarda, según creo, con \n; lo que sucede es que el html no lee ese salto directamente y necesita de la ayuda de la programación para insertar <br/>. Pregunta en el foro PHP, como te han recomendado, pero te anticipo que aplicando la función nl2br a la cadena que saques de la tabla te insertará esos saltos que tanto añoras
http://fr.php.net/nl2br