tontxusp, no deberías tener problemas instalando un simple .htaccess de hecho, es una variante del servidor web muy utilizada, y si en el archivo de configuración de apache el uso de .htaccess está habilitado debe ser porque está todo bien con emplearlo.
Te recomiendo utilizar la herramienta "Lockit" si no conoces el funcionamento del .htaccess y .htpasswd:
De ahí te lo puedes bajar directamente
http://www.infranetworking.com/verRecurso.php?Recurso=9
Saludos,
Daniel.-