Para que el pop-up vaya el frente tienes que "darle foco".
Ejemplo:
Código:
<script language="javascript" type="text/javascript">
<!--
function displayWindow(url)
{
newwindow = window.open(url,'name','height=200,width=150');
if (window.focus) {newwindow.focus()}
return false;
}
// -->
</script>