Debes por fuerza hacer una llamada al servidor, que es donde está PHP, ya sea recargando la página o llamando a otra, o bien de forma asíncrona usando Ajax para que no se recargue toda la página.
La primera forma es más fácil. Pásale la variable por la URL en la llamada, y que PHP pueda recogerla por el método GET. Algo así:
Código:
//se hace la rellamada mediante javascript
window.location.href="ruta_al_php/miPHP.php?variable=" + confirma
Código PHP:
// PHP:
$miVar = $_GET['variable'];
si haces que todo pase en la misma página, pon el PHP así:
Código PHP:
if (isset($_GET['variable'])) {
$miVar = $_GET['variable'];
}