Holaa caricatos,... logre revisar mejor lo que me enviaste y logre solucionar mi problema. Presento la solución, por si a alguien le salta la misma duda. Gracias por tu ayuda.
Código:
<form id="form1" name="form1" method="POST" action="sistema_subcomision2.php" target="ventanaForm" onsubmit="window.open('', 'ventanaForm', 'toolbar=no, location=no, directories=no, status=no, menubar=no ,scrollbars=no, resizable=no, fullscreen=yes')">
Simplemente defino un target y en onsubmit hago window.open para llamar a una ventana secundaria maximizada (y ya no utilizo la funcion javascript pantalla completa que al principio habia definido). Todo esto dentro de la etiqueta form. Gracias nuevamente.