¿Porque esta lista enlazada funciona rara? (C)

[0absolut0]

Puedes probar a poner una traza despues del if/else para saber si el programa se muere o sigue vivo en ese punto, porque debería de pintar o bien lo del if o bien lo del else.

Otra posibilidad (remota) es que necesites vaciar el buffer de stdout con fflush(stdout) despues de hacer el printf.