Actualmente lo estoy realizando asi, segui la indicacion del post.
Pero no se abren los scripts .js :( 
Llevo harto rato pegado en esto...he realizado todos los seguimientos y no doy con la solución. 
Este es mi código JS para interactuar con Ajax:  
Código:
 	 	AjaxOBJ.open("POST", "PresupuestoInicial_buscarTipoCuentas.php", true);
	    AjaxOBJ.setRequestHeader("Content-Type","application/x-www-form-urlencoded");
		AjaxOBJ.onreadystatechange=function() {
				
				if (AjaxOBJ.readyState==4) {
					if (AjaxOBJ.status==200){
						
						var scs = AjaxOBJ.responseText.extractScript();
						document.getElementById("cuentas_listado").innerHTML = AjaxOBJ.responseText;
						scs.evalScript();
					} 
				}
		}
		AjaxOBJ.send("tipo_cuenta_seleccionado="+ tipo_cuenta_seleccionado);
  Saludos