simplemente
if ($contrasena1 != $contrasena2) {
echo "las contraseñas no concuerdan";
exit();
}
pero claro, eso lo tienes que formatear mejor
Te recomiendo que tambien lo compruebes en javascript, pero eso no quieta que lo compruebes en php, ya que la proteccion javascript se puede saltar facilmente al ser de lado del cliente
http://www.desarrolloweb.com/articulos/1767.php
Saludos