Creo que esto es lo que quieres hacer
Código PHP:
echo "<table>
<tr>
<td>";
$query1=mysql_query("SELECT fecdib FROM prototipo WHERE(nroite='$nroite')");
$sql1=mysql_fetch_array($query1);
if($sql1[0]!=0000-00-00){
echo $sql1[0];
} else {
echo "<input type='checkbox' name='check1' value='$fecha' />";
}
echo "</td>
</tr>
</table>";
Espero te sirva