Hola
Primero que todo que ¿sistema operativo tienes en la pocket?
Para crear proyectos para dispositivos móviles en VS 2005 debes instalar el SDK 5 o el ultimo SDK 6
Una vez instalado podras ver en los tipos de proyectos dentro de
SmartDevice Alli te aparece una opcion
Windows Mobile X Pocket PC, Creo que la X es la vesion del SDK.
Y para ejecutar el proyecto en la pocket debes tener instalado el Compac Framework 2.0 en el dispositivo y si trabajas con SQL para las bases de datos debes instalar el SQL CE en el dispositivo.
Te recomiendo que pases por
http://foro.todopocketpc.com/ alli hay links muy buenos para las personas que estamos comenzando con el desarrollo de estas aplicaciones.
Saludos