Con esta funcion en tu popup puedes hacer que la pagina se recargue.
function actualizaVentana(){
//Si quieres actualizar la ventana para que se rediriga a otra pagina
//Si quieres agregarle valores utiliza pagina.php?variable=valor&variable2=valor
window.opener.location.href = "pagina.php";
//Si quieres que se actualice la misma pagina por cambiar datos en base de datos
window.opener.location.reload();
}
Suerte!