Hola,
yo por lo que veo es que al cambiar el Javas:
1- Recuperas todos los valores del formulario
2- Recalculas Tara con el nuevo valor
3- Recalculas Neto, pero con el valor del formulario, no con el recalculado, y por eso no te cambio.
y con el resto de valores calculados pasa lo mismo, los recalculas con los valores ya existentes en el formulario, no con los recalculados.
Salu2