Al ejecutar el phpinfo() hay dos columnas, una con los valores indicados en el php.ini y otra con los valores locales, usualmente definidos mediante el .htaccess.
Con el .htaccess con la linea que indicas sólo se modificaría la columna que corresponde a la configuración local.
En todo caso, si no te funciona es que tu servidor no te permite el uso de archivos .htaccess. Podrías contactarte con ellos y pedir que te lo habiliten, o en todo caso usar
este script (que ya lo conoces) para limpiar las variables.
Saludos,