Hola:
Evidentemente solo te importa usar explorer, así que poco te podré ayudar (y los que programamos pensando en que nuestro trabajo funcione bien en todos los navegadores...) pero no te confundas... solo hay tres ventanas modales: alert, confirm y prompt; otras ventanas son los popups, y si eso es lo que quieres, tal vez no leiste el artículo adecuado:
Formularios y enlaces dirigidos a ventanas
Saludos