sé que para habilitar todos los permisos de un directorio al crearlo usas
Código PHP:
mkdir($path,0700);
sinendo 0700 el número hexadecimal que representa a 0x0700
cuando subes un archivo, puedes colocarlo en esta carpeta creada con todos los permisos, y tendrás todos los permisos para ver, modificar y borrar estos archivos.
