Quizás no sea problema del servidor, sino del sistema de archivos al que quieres descargar el archivo, o del gestor de descargas.
Si intentas descargarlo a una partición FAT32, debes saber que tal partición no acepta archivos de más de 4 GB.
Si el problema no es de la partición, tal vez sea del programa utilizado para la descarga, como aquí:
http://debian.barrapunto.com/~Defero/journal/14015