Recoger solo el valor de los checkbox marcados

[yomesmo]

Chupao, yo mesmo me lo acabo de resolver, lo dejo para la posteridad:

for (var i=0; i <= Formulario.elements.length-1;i++) {

if (Formulario.elements[i].type=='radio'){
if (Formulario.elements[i].checked){
cadenaFormulario += sepCampos+Formulario.elements[i].name+'='+encodeURI(Formulario.elements[i].value);
}

}
else
{
cadenaFormulario += sepCampos+Formulario.elements[i].name+'='+encodeURI(Formulario.elements[i].value);
}
sepCampos="&";