Voy a autoresponderme. Conseguí reparar el error:
Buscan en internet encontré que al crear el .htaccess cometí ciertos errores y que las rutas podría regenerarlas para que funcionaran una vez más. Me fuí al panel de Wordpress y en opciones después permalink cambié la forma en que se verán los enlaces, le dí guardar y luego escogí la que anteriormente tenía corrigiendo así el error y dejando la estructura de los hipervínculos como la deseaba.
http://codex.wordpress.org/Using_Permalinks