Hola
camiluna83,
Respecto a tu consulta, Plesk lo he utilizado varias veces hace unos meses en un VPS, es un sistema muy estable y seguro, y lo vale, respecto a cPanel, tiene algunas desventajas como las que tu nombras, pero es algo más masivo, y la gente lo conoce más, aunque Plesk tambien es uno de los mejores del mercado, si te inclinas por Plesk, puedes destacarte demostrando el excelente panel que es.
Espero que te haya sido útil mi pequeño punto de vista.
Te deseo suerte!