Hola, en muchas ocasiones ese problema se soluciona desfragmentando la unidad donde se encuentra el sistema operativo asi como hacerle un chkdsk, para hacer ambas operaciones, le das clic derecho a la unidad->Propiedades->Pestaña Herramientas y primero utilizas la herramienta de Desfragmentación, cuando esta culmine reinicias el sistema, luego eliges la opción de Comprobación de errores, reinicias el sistema y esperas a que culmine la operación, cuando este haya terminado, reinicias nuevamente el sistema y verificas como va todo.
Saludos