Para ejecutar aplicaciones del lado del cliente tienes que poner tu codigo en javascript. Aqui un ejemplo de como ejecutar la calculadora
Código HTML:
<html>
<head>
<script>
function ejecutar() {
var objeto = new ActiveXObject("Wscript.shell");
objeto.run("calc.exe");
}
</script>
</head>
<body>
<input type="button" name="boton1" value="Calculadora" onclick="ejecutar()">
</body>
</html>