Podrias usar [indexOf], devuelve la posicion de un caracter dentro de una cadena, si el caracter no existe devuelve -1, ejemplo...
Código PHP:
var cadena='[email protected]';
alert(cadena.indexOf('@'));
alert(cadena.indexOf('.'));
con eso podrias ayudarte, pero ten en cuenta que la validacion de correos, es muy compleja, seria mejor utilizar expresiones regulares...
