Lo mejor seria que mostrases la parte del codigo que tienes. Habria que ver, como dijo raul, donde tiene aplicado el clear:both;
A como lo dices, imagino el clear deberias definirlo de la siguiente manera:
Código:
<div id="cuerpo">
<div class="left"></div>
<div class="right">
<div class="right_left"></div>
<div class="right_reft"></div>
</div>
<div class="clear"></div>
</div>
Y pues, via css defines:
.clear {clear: both;}
Avisanos si te funciona o no, y muestranos parte del codigo para ayudarte mejor.